之前朱清時(shí)曾經(jīng)坦率地說(shuō)過(guò)，任何重要的改革都是越過(guò)法規(guī)的，如果強(qiáng)調(diào)不能越過(guò)，那就不能進(jìn)行改革。如果教改不能進(jìn)行，那他擔(dān)任南科大校長(zhǎng)也就失去了意義。這番話曾讓人猜測(cè)，朱清時(shí)校長(zhǎng)是不是做好了要知難而退的準(zhǔn)備？面對(duì)這樣的疑問(wèn)，朱清時(shí)說(shuō)，他還沒(méi)有時(shí)間為自己想退路，盡管困難重重，但他仍然沒(méi)有絕望。

朱清時(shí)：我其實(shí)以前就估計(jì)到這個(gè)難度會(huì)很大，但是沒(méi)有想到會(huì)這么大，會(huì)來(lái)得這么快。我至今仍然抱著希望能夠化解這些，南科大仍然保持最初做中國(guó)教改試驗(yàn)田的這種目標(biāo)前進(jìn)，所以我還沒(méi)有絕望，還希望能夠繼續(xù)做下去。

學(xué)生們?cè)诠_(kāi)信中寫(xiě)下這樣一段話：“我們對(duì)自己的選擇堅(jiān)定不移，對(duì)南科大的未來(lái)充滿希望。但是我們同時(shí)也是無(wú)助的，我們僅僅是學(xué)生，我們需要大家對(duì)我們學(xué)校有一個(gè)既不過(guò)度悲觀也不過(guò)度樂(lè)觀的看法?！敝烨鍟r(shí)說(shuō)，今天的南科大沒(méi)有失敗。他也堅(jiān)信，總有一天，南科大會(huì)成功。

朱清時(shí)：不管我們是否能把南科大建成原來(lái)預(yù)訂的那個(gè)目標(biāo)——一流研究型大學(xué)，我們付出的勞動(dòng)，我們的努力，我們辛苦包括這些孩子們的參與，都非常有價(jià)值，就是通過(guò)實(shí)驗(yàn)來(lái)回答了錢(qián)學(xué)森的問(wèn)題：為什么我們國(guó)家沒(méi)有一流大學(xué)？這樣講，沒(méi)有失敗者，南科大這個(gè)理念是成功的。不管我們把南科大建成了一流大學(xué)還是沒(méi)有在我們手上建成，我相信將來(lái)有人一定會(huì)把它建成。(馮會(huì)玲)